A estrutura da Câmara Municipal de São José dos Pinhais é formada da seguinte forma:
Comissões – As Comissões são órgãos técnicos constituídos pelos próprios membros da Câmara, destinadas, em caráter permanente ou transitório, a proceder estudos, emitir pareceres especializados, realizar investigações e representar o Poder Legislativo. As Comissões são permanentes, especiais ou de representação. As Comissões Permanentes são: *Constituição e Justiça; *Finanças e Orçamento; *Viação e Obras Públicas; *Urbanismo, Habitação, Serviços Públicos e Meio Ambiente; *Educação, Cultura, Esporte e Lazer; *Saúde e Assistência Social; *Assuntos da Criança, Adolescente e Idoso; *Comissão de Agricultura, Comércio, Indústria e Turismo.